Rafael Moneori, Pritzker saria irabazi zuen arkitekto espainiar bakarrari (1996), enkargatu zioten proiektua, eta horretarako abstrakzio ukitu bat txertatu nahi izan zuen, Antoni Tàpies eta Pablo Palazuelo bezalako artisten estetikarekin eta arte zentroan dauden arte garaikideekin bat etorriz. Eraikinak unibertsitate-campuseko bi muinoen arteko harana hartzen du, biak lotuz; beraz, inguruko ingurunearekiko errespetua eta integrazioa eraikinaren ezaugarri nagusiak dira.

Barrualdean, eraikinak erakusketa-espazio handiak ditu, antzoki batekin batera bizi direnak, eta izaera didaktikoagoa duten hainbat gela, hala nola ikasgelak edo tailerrak, eta hirugarrenek alokatzeko eskuragarri dauden espazioak. 

Museotik, bisitariek Navarrako Unibertsitateko fakultate eta zentro guztien ikuspegi panoramikoa dute. Horrek eraikinak diziplina guztiak hartzen dituela ematen du aditzera, unibertsitate-museo honen misioarekin bat datorren ezaugarria: artearen eta zientzia guztien arteko elkarrizketa sustatzea.